Боголюбская икона Божией Матери была написана в ХII веке после чудесного явления Пресвятой Богородицы благоверному князю Андрею Боголюбскому. Князь направлялся из Киева в Суздаль. Проезжая свой удельный город Вышгород, он, по внушению Свыше, тайно увез оттуда чудотворную икону Божией Матери, написанную евангелистом Лукой. Князь Андрей имел намерение отвезти икону в Ростов Великий. 18 июня 1155 года, во время пути, недалеко от Владимира-на-Клязьме, кони княжеской дружины внезапно остановились и не могли сдвинуться с места, удерживаемые невидимой силой.
После долгой молитвы князя и его духовника явилась Сама Владычица Богородица со свитком в правой руке и сказала, что не желает, чтобы Ее образ был поставлен в Ростове. Она повелела отнести икону во Владимир, а на месте Ее явления построить каменную церковь в честь Ее Рождества. Затем Пресвятая Дева молитвенно обратилась к Своему Сыну и Богу, чтобы Он принял всякого человека, призывающего Ее имя и просящего Ее заступничества. Во время молитвы Божией Матери над землей явился Спаситель, благословляя Ее.
Исполняя волю Царицы Небесной, князь Андрей отвез икону во Владимир, где впоследствии построил каменный собор в честь Успения Божией Матери, в который был перенесен чудотворный образ. Эта икона стала называться Владимирской. На месте явления Пресвятой Богородицы святой князь Андрей поставил Богородице-Рождественскую церковь.
Монастырь и город, образовавшиеся вокруг церкви, он назвал Боголюбовым. В память о чудесном явлении князь Андрей велел написать икону, изобразив на ней Богородицу так, как Она ему явилась: во весь рост, со свитком в правой руке и ликом, обращенным к Спасителю, также изображенным на иконе благословляющим с небес Свою Пречистую Матерь.
Празднование иконе, названной Боголюбской, было установлено 18 июня (1 июля). Икона известна как чудотворная. За восемь столетий появилось много списков Боголюбской иконы. Один из первых – икона Божией Матери Боголюбская Московская – сделанный в 1157 году, находился в Москве над Варваринскими воротами Китай-города. Эта икона также прославилась чудотворениями. До наших дней дошли различные списки Боголюбской Московской иконы: на самом распространенном из них Божия Матерь изображена в полный рост с предстоящими Ей коленопреклоненными Московскими святителями и иными русскими святыми.
В соборе монастыря находятся списки с обеих икон – Боголюбской (большая икона на северной стене центрального придела, у иконостаса) и Боголюбской Московской с предстоящими Московскими святителями и русскими святыми (в притворе, слева от входа). Иконы переданы обители вместе с церковным имуществом прихода собора Рождества Пресвятой Богородицы в 1993 году при упразднении прихода и открытии монастыря. Обе иконы (особенно – большая, находящаяся у иконостаса) чтимы прихожанами монастыря.